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透過 JNDI 方式定義資料連結，首先在應用伺服器配置好 JNDI，然後在設計器中直接呼叫 JNDI 的名稱，選擇連結資料庫所需要的驅動過程等操作，即可成功使用 JNDI 連結。
菜單欄點選【伺服器】→【定義資料連結】，選擇【建立資料庫】，選擇【JNDI】 方式連結，如下圖所示。
輸入 JNDI 的名稱，與 Web 應用定義的 JNDI 名稱相同，並且選擇相應 Web 伺服器的驅動過程及連結資料庫的 URL 即可。
各種 Web 伺服器的 JNDI 資料源呼叫方式有所差別，設定方法將在各自文檔分別介紹，如：Tomcat 配置 JNDI 連結、Weblogic 配置 JNDI 連結。
選中連結資料庫所需要的驅動過程。
注意：需要把包含 INITIAL_CONTEXT_FACTORY 類的 JAR 檔案copy到【%FR_HOME%/lib】目錄下。
注：由於 JNDI 的驅動過程過大，軟體不自帶。如果想要使用本功能，可以選擇自己下載後放到【%FR_HOME%\webapps\webroot\WEB-INF\lib】目錄下。也可以不下載驅動，使用上面連結的文檔中的方法在不同伺服器上使用 JNDI 資源。
點選 JNDI 資料連結介面的【其他屬性】，可彈出 JNDI 環境變數設定介面，如下圖所示。
JNDI 環境變數的介紹參見文檔：JNDI環境變數。
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